Weir博士重获新生，McKay博士试图拯救遭受复制者攻击后早已成千疮百孔的亚特兰蒂斯。可供使用的能源仅可维持24小时，又无法使用星际之门，亚特兰蒂斯小队能否再次战胜世界末日......McKay与Sheppard计划从复制者的手中夺回ZPM。而与此同时，SamanthaCarter会同Apollo正在找寻传说中遗失的城市--亚特兰蒂斯。McKay他们的计划能否成功?Carter能否找到遗失城市的所在?

在神秘的南极冰层里，发掘出星际之门建造者遗弃的基地。星际之门亚特兰蒂斯小队应召执行一次冒险性最大的星际之门任务——前往遥远的天马星系。亚特兰蒂斯小队遭遇古代人类文明的袭击...包括不断威胁人类生命无处不在的新敌人——TheWraith.ElizabethWeir博士是亚特兰蒂斯小队的队长，她是一个外交关系专家。她拥有出色的政治才能，但在军事上喜欢虚张声势，在军队里面担任少校之职。JohnSheppard是一个天资聪颖的驾驶员。陆军少尉AidenFord担任副驾驶员，他是一个年轻热情的军官。RodneyMc

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电视剧版。AmandaTapping饰演一位157岁的HelenMagnus博士，英国维多利亚时代皇家学院第一批女博士之一，她曾和开膛手杰克订婚并有了一个女儿Ashley。不过Ashley不知道他的父亲是杰克。Magnus博士父亲创立了一家神秘生物的庇护所，这些生物从全世界搜集而来。在研究这些生物的过程中，Magnus博士发现她获得了长寿。